親水C18色譜柱在用于分離疏水性化合物與常規的C18相具有相似的選擇性，所以也可以作為一種通用C18柱使用。親水性色譜柱是專為親水性和極性化合物具有更強的保留能力和選擇性而設計的。典型的應用是對生物分子、代謝物和藥物降解產物如有機酸、水溶性維生素、低聚糖、氨基酸以及小分子縮氨酸和小分子核苷等進行分離。